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实验服务 高通量测序

简要描述:

服务说明:
1、提供实验材料,其必须保证新鲜,请您采样后立即放入液氮中速冻或加入样品稳定剂。
2、如果提供DNA,我们要对其进行评估。基因组DNA无明显降解,浓度≥500 ng/ul,总量
   大于30μg。
3、如果样品可以用Trigol法提总RNA ,也可以将样品研

更新时间:2021-03-18

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高通量测序

 

服务编号服务项目收费标准(元)实验周期
FZ32基因组de novo测序面议面议
FZ33基因组重测序面议面议
FZ34宏基因组测序面议面议
FZ35小RNA测序面议面议
FZ36真核生物转录组测序面议面议
FZ37简化基因组测序面议面议
FZ38细菌16S测序

产品介绍:
服务内容:
基因组de novo测序
1  基因组DNA提取
2  构建不同长度的基因组文库
3  上机测序
4  数据处理:去除接头序列、污染序列等
5  基因组拼装统计:原始数据统计、测序深度分析、覆盖度统计、GC含量分析等;
6  基因组注释:基因预测、基因功能注释、重复序列分析、nocoding RNA注释等;
7  基因功能分析 GO分析,KEGG通路分析等;
8  比较基因组学及进化分析:物种系统发育树构建、基因家族鉴定、基因共线性分析等。
 
基因组重测序
1  基因组DNA提取
2  构建基因组测序文库
3  上机测序
4  数据处理:去除接头序列、污染序列等
5  序列比对
6  SNP、 InDel、CNV、SV检测等
 
宏基因组测序
1  基因组DNA提取
2  构建基因组测序文库
3  上机测序
4  数据处理:去除接头序列、污染序列等
5  宏基因组组装:原始数据统计、测序深度分析、覆盖度统计、GC含量分析等;
6  样品复杂度分析:将测序所得Reads与业数据库进行比对统计;
7  物种分类:基因预测、相对丰度计算等;
 
真核生物转录组测序
1  RNA提取
2  构建测序文库
3  上机测序
4   数据分析:
     无参考基因组的转组分析
Ø 基本数据处理(图像识别,碱基识别,测序街头序列过滤,样品污染可能性检测)
Ø 测序数据产量统计,数据成分和质量评估;
Ø Contig及Scaffold长度分布;
Ø Unigene的长度分布,GO分类,功能注释,代谢通路分析,表达差异分析。
有参考基因组的转录组分析
Ø 基本数据处理(图像识别,碱基识别,测序街头序列过滤,样品污染可能性检测);
Ø 与参考基因组比对后的注释信息;
Ø 基因在基因组上的分布;
Ø 测序深度分布,测序随机性评估,基因差异表达分析;
 
Small RNA测序
1  RNA提取
2  连接接头及纯化Samll RNA
3  上机测序
4  数据处理:去除接头序列、污染序列等
5  样品间的公共序列和特异序列的分析
6  Small RNA 与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA的比对信息
7  Small RNA 与重复序列的比对信息(需提供选定参考基因组对应的重复序列注释信息);
8  Small RNA 与 miRBase 中范围的已知的 miRNA 的比对;
9  按照优先将 small RNA 进行分类注释; 
10 利用Mireap 对没有注释的small RNA 进行预测,预测新的 miRNA ;
11样品间miRNA 差异分析(2个或2个以上样品)和聚类分析(3个或3个以上样品) ;
12  MiRNA 靶基因预测(需要提供基因编码序列);
 
简化基因组测序
1  基因组DNA提取 酶切 接接头
2  上机测序
3  数据分析
 
未知参考基因组的信息分析流程
Ø 原始数据整理、过滤及质量评估;
Ø 标记位点分析(标记位点鉴定,SNPs位点与InDel位点鉴定);
Ø 全基因组关联分析(GWAS);
Ø 连锁分析和QTL定位;
Ø 种群进化分析。
已知参考基因组的信息分析流程      
Ø 原始数据整理、过滤及质量评估;
Ø 标记位点分析(标记位点鉴定,SNPs位点与InDel位点鉴定);
Ø SNP单体型图谱分析;
Ø 全基因组关联分析(GWAS);
Ø 连锁分析和QTL定位;
Ø 种群进化分析。
 
细菌16S rDNA测序
 
1  基因组DNA提取 PCR扩增
2  上机测序
3  原始数据整理、过滤及质量评估;
4  OTU列表生成及注释;
5  丰度分析(Alpha多样性分析、物种丰度差异分析、聚类分析);
6  群落结构分析(单样品物种分布、 多样品物种分布、含进化关系的
物种分布、Beta多样性分析)。
服务说明:
1、提供实验材料,其必须保证新鲜,请您采样后立即放入液氮中速冻或加入样品稳定剂。
2、如果提供DNA,我们要对其进行评估。基因组DNA无明显降解,浓度≥500 ng/ul,总量
   大于30μg。
3、如果样品可以用Trigol法提总RNA ,也可以将样品研磨后放在 Trigol中。
4、如果提供RNA,我们需要我们评估请提供浓度≥500 ng/ul,总量≥20 ug 的total RNA样品
   样品请去蛋白并进DNase处理。
 

 

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