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用于单分子长读取测序的高分子量基因组DNA的提取方法
点击次数:1379 发布时间:2016-11-24

复杂基因组从头测序是研究人员寻求高质量参照序列的主要挑战之一,许多从头组装都是基于短序列,组装成片段的基因组序列。第三代测序技术的读取长度大于10 Kb,这将有利于复杂基因组的组装,但是这些技术要求高分子量的基因组DNA,常用的基因组DNA提取方法所提取到的基因组DNA可用于获取较小片段并进行短读取测序,但是这些基因组DNA并不适用于第三代测序技术。利用细菌人工染色体构建基因文库的方法也许适用,但是这些方法不但耗时,而且用于这些方法的试剂盒较为昂贵。这里,法国科学家Baptiste Mayjonade等人提供了一种快速廉价的从细菌、植物和动物中提取高分子量基因组DNA的方法。这一方法已通过验证,以向日葵叶子为样本,其平均读取长度为12.6 Kb,zui大读取长度为80 Kb

 原文:

Baptiste Mayjonade, Jérôme Gouzy, Cécile Donnadieu et al, Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for long-read sequencing of single molecules. BioTechniques 61:203-205 (October 2016).

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